Le programme des EFD dure, en règle générale, entre 5 1/2 à 6 mois.
Il est modulaire, c’est à dire que chaque semaine est consacrée à un ou deux sujets qui seront traités en profondeur. Il est aussi basé sur la vie communautaire. Des équipiers de Jeunesse en Mission (JEM) dirigent l’école, mais les intervenants de chaque semaine sont des orateurs venant de divers horizons culturels et confessionnels et de ministères différents (JEM ou autres). Nous croyons en l'importance d'une grande diversité culturelle dans la communauté qui constitue l'EFD; les "chocs" culturels étant très bénéfiques dans ce mode de formation !La première partie de l’école, appelée phase théorique, dure 12 semaines et s’organise de la manière suivante :
-3 à 5 heures de cours par jour.
-1 heure consacrée, en début de journée au culte personnel.
-Des temps de petits groupes de partage.
-Des temps d’intercession (3 heures minimum par semaine) et de louange répartis sur l’ensemble de la semaine.
-Des ateliers de préparation à l’évangélisation (prédication, chant, mime, danse, marionnettes, etc.).
-Des temps de travaux personnels : lecture, journal personnel, recherches.
-Des travaux pratiques : travaux ménagers, participation à certaines activités pratiques du centre de JEM accueillant la formation, etc.
-Des temps d’entretien personnel avec un encadrant ou avec l’orateur de la semaine.

L’orateur invité est un excellent complément à l’expérience des encadrants de l’EFD. La disponibilité et l’engagement consacré des équipiers de J.E.M, en même temps que la proximité de lieu, d’âge et d’expérience avec les étudiants, pourvoient à des occasions immédiates de mise en pratique de l’enseignement.

Le nombre d’étudiants dans une EFD varie de 12 à 25 étudiants. En règle générale, les encadrants, les orateurs et les étudiants vivent sur le mode communautaire, partageant leurs repas et les travaux pratiques. Les week-ends sont consacrés au repos, au culte dominical dans les églises de la région, et occasionnellement à des activités d’évangélisation ou d’animation de groupes de jeunes.

La phase pratique, de 10 à 12 semaines, se déroule "sur le terrain", généralement dans un pays du monde francophone. Elle consiste en une période d’apprentissage ponctuée d’évangélisation sous diverses formes, de service pratique auprès des églises locales du pays (rénovation de bâtiments par exemple), d’actions à caractère humanitaire ou de développement (les enfants de la rue, les lépreux d’une grande ville, construction de latrines, distribution de mil, etc.). Comme au cours de la phase théorique, des temps d’enseignement, de groupes de partage, d’intercession et de louange sont organisés tout au long du séjour.

La vie au sein d’une communauté missionnaire inter-culturelle et l’immersion dans une vie de prière et de louange quotidienne, basées sur une vie d’activité pratique et sur le partage dans les petits groupes, le tout combiné à un enseignement biblique, constitue une excellente expérience de formation.